Etant donné que chkdsk utilise les fichiers de windows pour scanner le disque, on peut dire que oui puisqu'avec UBCD, windows n'est pas en cours donc le disque est totalement libre pour le scan, il n'y a pas de risque de secteur verrouillé par windows ou autre.
Au niveau réparation, c'est sensiblement la même chose, utiliser chkdsk c'est utiliser windows, donc si windows a un souci, chkdsk peut ne pas fonctionner correctement. UBCD étant un système entièrement à part, aucun problème sur le disque ne peut interférer avec le résultat de scan ou de la "réparation".
Cependant il faut bien rappeler que des erreurs disque, ca ne se répare pas avec des logiciels. Que ce soit chkdsk, ubcd ou autre, ils ne font que permettre de contourner les problèmes si c'est possible. Mais il faut surveiller le nombre d'erreur et s'il grandit, il faudra envisager de remplacer le disque puisque rien ne peut corriger l'usure physique du disque.